盡管蘑菇的蛋白質含量不算很多，但其中含有大量不同類型的氨基酸及與氨基酸有關的含氮物質，尤其是人體所必需的8種氨基酸，在蘑菇中都已具備。實驗研究表明，蘑菇浸出液中有若干種類型的多糖體，含有干擾素誘導劑，可大大增強人體對癌癥的抵抗力，因此，被稱之為“天然抗癌良藥”。

蘑菇的不同部位，營養物質的含量也有所不同。一般來說，菌蓋比菌柄營養更加豐富，最適于食用的是新鮮的較幼嫩的蘑菇的子實體。

蘑菇還含有豐富的礦質元素，其中所含的微量元素硒，可以使血中谷胱甘肽過氧化酶的活性增強，能防止過氧化物損害機體，并且還能有效提高身體免疫力。蘑菇所含的大量植物纖維，具有防止便秘、促進排毒、預防糖尿病及大腸癌、降低膽固醇含量的作用，而且它所含有的熱量較低，可以防止人體過于發胖，是一種比較理想的美容減肥食品。

蘑菇是天然食物中維生素D的主要來源之一。蘑菇中維生素D的含量相當于人體每天所需的 8.69倍。而人們在補鈣的同時，維生素D的攝入可促進鈣的吸收利用，有益于骨骼的健康生長。因此，對青少年、老年人和那些需要補鈣的人群來說多吃蘑菇是非常有益處的。